很多做试管婴儿的准爸爸准妈妈也许会有这个顾虑，试管婴儿真的会特别聪明吗？其实并不是这样的。试管婴儿和其他普通的宝宝一样。试管婴儿这个过程不会改变孩子的智力。试管婴儿过程中精子和精子结合在一起形成孩子，对孩子的智力有影响，这是不存在的。精子和卵子在实验室结合，以及精子和卵子在女性体内结合的区别只是只是所结合的地方不一样而已，所以网上所传的试管婴儿特别聪明，都是站不住脚的。

有一种特殊的情况就是因为男方或者女方的问题，需要借精子或者卵子才能做试管婴儿。这类试管婴儿人群可能会根据智力选择捐精者或捐卵者。但大多数试管婴儿也不是通过捐献的精子或卵子出生的，而是来自他们自己的母亲或父亲。无论哪种方式都无所谓。智力在很大程度上是由基因决定的，而且在一定程度上也是由环境决定的。但是，一旦孩子开始产生意识并开始学习东西的时候，环境因素就会起到决定性的作用，而不是之前的基因。
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据英国《每日邮报》报道，上世纪90年代，英国妈妈接受了一种新型的试管婴儿治疗，其孩子比自然受孕的孩子更聪明。

曾有人担心，这种被称为细胞内精子注射(ICSI)的手术可能会增加发育迟缓和行为问题的风险。但一项新的研究表明，ICSI儿童的智商远高于自然受孕所生的儿童，而不是处于劣势。
原因被认为是心理上的影响，而不是生理上的。
因为大部分寻求试管婴儿治疗的夫妇往往比平均年龄大，并且有生育失败的历史。研究人员认为，作为这个群体，他们可能是特别专注孩子的培养，愿意把额外的注意力放在孩子身上，这可能会对孩子的发展和智力产生连锁反应。
ICSI于1992年引入，涉及将单个精子注入卵子，而不是允许在培养皿中随机受精。在英国进行的所有试管婴儿治疗中，近一半现在使用ICSI程序。来自布鲁塞尔自由大学的比利时心理学家Lize Leunens将151名ICSI儿童与另一组同样大小的自然受孕儿童进行了比较。
ICSI组的平均智商为112，而非试管婴儿组的智商为107。